BIOSTICKER

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BioSticker est une série de conférences mensuelles autour de la bioinformatique et dans le périmètre des laboratoires en STIC des Pays de la Loire.

Le principe est simple : un orateur « local » invite un orateur extérieur, proche de ses thématiques de recherche ou ayant un projet de recherche en commun. Pendant les 15 premières minutes, l’orateur local présente ses thématiques et introduit l’orateur invité qui donne ensuite une conférence dans un format plus habituel (45 minutes plus questions).

Pour consulter la liste de tous les séminaires, visitez la rubrique Séminaires passés.


Prochain séminaire

19 mai 2017

Horaire :  10h30

Lieu :  Amphithéâtre – LS2N (Bâtiment 34, Université de Nantes, UFR Sciences et Techniques, 3 chemin de la Houssinière 44300 Nantes)

Orateur invité :  Aurélien Serandour (CRCINA équipe 11, Centrale Nantes)

Titre : Epigenomics: a tool to understand transcription regulation in cancer

Résumé : Scientists have studied human mutations of the coding genome for decades. This is in fact the tip of the iceberg of human disease-related mutations. More than 90% (maybe more) of the SNPs identified in GWAS studies are in fact located in non-coding regulatory elements (non-coding RNA, promoters, enhancers, insulators, splicing sites etc). I will show you how -omics methods allow us to better understand transcription regulation by non-coding regulatory elements in cancer and human diseases.
In particular, epigenomics methods provide genome-wide mapping of transcription factors binding, histone and DNA modifications. Our current aim in Team 11 CRCINA (PI: S. Minvielle) is to map the active regulatory elements in clinical samples (normal plasma cells and multiple myeloma) so that we can identify key regulatory elements and key transcription factors implicated in the disease.


Les équipes

  • ICLN (Interaction, Connaissances et Langage Naturel) – LERIA, Angers
  • MOA (Métaheuristiques, Optimisation et Applications) – LERIA, Angers
  • SDO (Systèmes Dynamiques et Optimisation) – LARIS, Angers
  • MeForBio (Méthodes Formelles pour la Bioinformatique) – LS2N, Nantes
  • DUKe (Data User Knowledge) – LS2N, Nantes
  • COMBI (Combinatoire et Bioinformatique) – LS2N, Nantes

Contact

Pour toute demande d’information, merci de prendre contact avec les organisateurs du séminaire :

  • Abdelhalim Larhlimi (COMBI, LS2N – Nantes) : abdelhalim -dot- larhlimi -at- univ-nantes.fr
  • Géraldine Jean (COMBI, LS2N – Nantes) : geraldine -dot- jean -at- univ-nantes.fr

Groupement de Recherche en Intégration de données Omics à Très grande Echelle