Publications HAL des membres

Sandie Arnoux

      2019

    • [1] Neighbourhood contacts and trade movements drive the regional spread of bovine viral diarrhoea virus (BVDV)
      Luyuan Qi, Gaël Beaunée, Sandie Arnoux, Bhagat Lal Dutta, Alain Joly, Elisabeta Vergu, Pauline Ezanno.
      https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02120535
    • [2] EMULSION: Transparent and flexible multiscale stochastic models in human, animal and plant epidemiology
      Sébastien Picault, Yu-Lin Huang, Vianney Sicard, Sandie Arnoux, Gael Beaunée, Pauline Ezanno.
      https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02288201
    • [3] A Service-based Framework for Building and Executing Epidemic Simulation Applications in the Cloud
      Nikos Parlavantzas, Linh Pham, Christine Morin, Sandie Arnoux, Gael Beaunée, Luyuan Qi, Philippe Gontier, Pauline Ezanno.
      https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02312313

      2018

    • [4] Gestion des maladies endémiques du troupeau auxterritoires : contribution de la modélisationépidémiologique pour soutenir la prise de décision(PIA MIHMES, 2012-2017)
      Pauline Ezanno, Gael Beaunée, Sébastien Picault, Sandie Arnoux, Vianney Sicard, François Beaudeau, Arnaud Rault, Elisabeta Vergu.
      https://hal.inrae.fr/hal-02734603
    • [5] Gestion des maladies endémiques du troupeau aux territoires : contribution de la modélisation épidémiologique pour soutenir la prise de décision (projet MIHMES, 2012-2017)
      Pauline Ezanno, Gael Beaunée, Sébastien Picault, Sandie Arnoux, Vianney Sicard, François Beaudeau, Arnaud Rault, Elisabeta Vergu.
      https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01954723

      2017

    • [6] DiFFuSE, a Distributed Framework for Cloud-based Epidemic Simulations: a Case Study in Modelling the Spread of Bovine Viral Diarrhea Virus
      Manh Linh Pham, Nikos Parlavantzas, Christine Morin, Sandie Arnoux, Luyuan Qi, Philippe Gontier, Pauline Ezanno.
      https://hal.inria.fr/hal-01612979
    • [7] DiFFuSE, a distributed framework for cloud-based epidemic simulations: a case study in modelling the spread of bovine viral diarrhea virus
      Linh Manh Pham, Nikos Parlavantzas, Christine Morin, Sandie Arnoux, Luyuan Qi, Philippe Gontier, Pauline Ezanno.
      https://hal.inrae.fr/hal-02736241
    • [8] DiFFuSE, a Distributed Framework for Cloud-based Epidemic Simulations: a Case Study in Modelling the Spread of Bovine Viral Diarrhea Virus
      Linh Pham, Nikos Parlavantzas, Christine Morin, Sandie Arnoux, Luyuan Qi, Philippe Gontier, Pauline Ezanno.
      https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01586945
    • [9] Controlling the spatio-temporal dynamics of tsetse flies in a cattle breeding region of senegal
      Hélène Cecilia, Ahmadou Dicko, Sandie Arnoux, Sébastien Picault, Augustin Bancé, Jérémy Bouyer, Pauline Ezanno.
      https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01605693
    • [10] An integrated epidemio-economic modelling framework of the complex interplay between pathogen spread and disease management: control of BVD within beef herds as a case study
      Laetitia Laguzet, Arnaud Rault, Sébastien Picault, Sandie Arnoux, Stéphane Krebs, Pauline Ezanno.
      https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01605066
    • [11] A mechanistic model of tsetse fly population dynamics in space and time calibrated on observed data in Senegal
      Hélène Cecilia, Ahmadou Dicko, Sandie Arnoux, Sébastien Picault, Jérémy Bouyer, Pauline Ezanno.
      https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01603043

      2016

    • [12] Spread and control of enzootic cattle diseases: a data-driven multiscale modelling framework to prioritize complex regional strategies
      Pauline Ezanno, Gaël Beaunée, Luyuan Qi, Sandie Arnoux, Elisabeta Vergu.
      https://hal.inrae.fr/hal-02792988

      2015

    • [13] Modelling the spread of bovine viral diarrhea virus (BVDV) in a beef cattle herd and its impact on herd productivity
      Alix Damman, Anne-France Viet, Sandie Arnoux, Marie-Claude Guerrier-Chatellet, Etienne Petit, Pauline Ezanno.
      https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01290663
    • [14] Modélisation du risque épidémiologique : vers des outils d'aide à la gestion. Cas de la maîtrise de la diarrhée virale bovine (BVDV) en troupeau bovin allaitant
      Pauline Ezanno, Fabrice Bidan, Sandie Arnoux, Guillaume Camanes, Alix Damman.
      https://hal.inrae.fr/hal-02739613
    • [15] Dynamic between herd model for Q-fever spread in dairy cattle to quantify the impact of different transmission pathways at regional scale
      Pranav Pandit, Pauline Ezanno, Elisabeta Vergu, Bhagat Lal Dutta, Sandie Arnoux, François Beaudeau, Thierry Hoch.
      https://hal.inrae.fr/hal-02742727
    • [16] A generic weather-driven model to predict mosquito population dynamics applied to species of Anopheles, Culex and Aedes genera of southern France.
      Pauline Ezanno, Melaine Aubry-Kientz, Sandie Arnoux, Priscilla Cailly, Grégory l'Ambert, Céline Toty, Thomas Balenghien, Anne-Lise Tran.
      https://hal.inrae.fr/hal-02636104

      2014

    • [18] Du modèle à l’outil d’aide à la gestion de la santé animale en élevage bovin : cas de l’infection par le virus de la diarrhée virale bovine (BVDV) en troupeau bovin allaitant
      Alix Damman, Sandie Arnoux, Guillaume Camanes, Fabrice Bidan, Pauline Ezanno.
      https://hal.inrae.fr/hal-02739007
    • [19] Des outils d'aide à la maîtrise des maladies infectieuses en élevage : illustration sur la BVD (Diarrhée Virale Bovine)
      Pauline Ezanno, Guillaume Camanes, Fabrice Bidan, Sandie Arnoux, Alix Damman.
      https://hal.inrae.fr/hal-02793344
    • [20] A generic framework to model infection dynamics in a metapopulation of cattle herds
      Sandie Arnoux, Yvon Jégou, Gaël Beaunée, Pauline Ezanno.
      https://hal.inria.fr/hal-01097441
    • [22] PASTEC: an automatic transposable element classification tool
      Claire Hoede, Sandie Arnoux, Mark Moissette, Timothée Chaumier, Olivier Inizan, Veronique Jamilloux, Hadi Quesneville.
      https://hal.inrae.fr/hal-02639360

      2011

    • [23] Use cases and improvements of REPET package : pipeline and tools to identify and annotate TEs in genomic sequences
      Veronique Jamilloux, Olivier Inizan, Sandie Arnoux, Timothée Flutre, Claire Hoede, Nathalie Choisne, Hadi Quesneville.
      https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01190364
    • [24] URGI genome annotation system:an integrated system for structural and functional genome annotation
      Joelle Amselem, Michael Alaux, Nathalie Choisne, Nicolas Lapalu, Baptiste Brault, Aminah Keliet, Erik Kimmel, Françoise Alfama, Sandie Arnoux, Marc Bras, Laetitia Brigitte, Olivier Inizan, Veronique Jamilloux, Jonathan Kreplak, Fabrice Legeai, Isabelle Luyten, Cyril Pommier, Sebastien Reboux, Stéphanie Sidibe-Bocs, Marc-Henri Lebrun, Delphine Steinbach, Hadi Quesneville.
      https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01019754

      2010

    • [25] REPET
      Hadi Quesneville, Timothée Flutre, Olivier Inizan, Claire Hoede, Elodie Duprat, Sandie Arnoux, Gaël Faroux, Françoise Alfama-Depauw, Delphine Autard, Benoit Bely, Marc Bras.
      https://hal.inrae.fr/hal-02820937
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Groupement de Recherche en Intégration de données Omics à Très grande Echelle